По словам Прохоровой, такое решение она приняла из-за своей личной позиции по Крыму. «В большинстве региональных отделений поддерживают присоединение Крыма. Как интеллектуал я не могу согласиться с этой позицией, это создает невероятно сложный конфликт между чувством и долгом. Я не могу допустить расколов в партии, поэтому принимаю это сложное решение», — сказала она.
По ее словам. партия должна выбрать нового председателя, который сможет высказывать позицию, более близкую нашим региональным отделениям. «А мне это даст свободу в собственных суждениях, — заявила Прохорова. — Если бы я высказывалась за присоединение Крыма, то чувствовала бы, что предаю себя».
Тем не менее, Прохорова не намерена покидать партию и останется членом «Гражданской платформы».
В конце мая в СМИ появились сообщения о том, что Ирина Прохорова и ее брат — основатель партии миллиардер Михаил Прохоров собираются покинуть «Гражданскую платформу». Однако вскоре эта информация была опровергнута.
Ирина Прохорова возглавила «Гражданскую платформу» в декабре 2013 года.